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转载 学习心得
gff3等文件转12列的bed文件 费劲千辛万苦,终于算成功了,还没测试最后的结果,不过估计差不多了 快哭了,弄了大半个晚上,因为使用convert2bed转换的bed文件并不是想要的,具体的导致差别的原因目前我还不清楚,总之,这个算是给自己的一个提醒,希望也能给其他人一个帮助。 使用transdecoder工具里面的脚本gff3_file_to_bed.pl会报错,现在还不知道为什么,UCSC的gff3ToGenePred.dms还没整明白,不过也能进行转换。bedops的gff2bed生成的也
2020-11-06 21:32:36 754
原创 利用python的selenium模块向Plant-mPLoc提交数据
利用python的selenium模块向Plant-mPLoc批量提交数据流程一般步骤1.对数据的预处理2. 环境的配置3.代码分析及流程思想 流程一般步骤 首先我们对得到的序列预处理,然后进行信息的提取,包括利用正则表达式对序列号的获取,以便序列号和数据结果的匹配和每次向网页提交一条完整的序列,最后是结果的保存。 1.对数据的预处理 因为笔者使用的是ExPASy对核苷酸序列开发阅读框进行...
2020-04-21 16:36:07 1100 1
空空如也
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