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原创 python对csv/excel类型文件的操作大全,有关pandas.read_csv读取方法,遍历表格中每个值,取行,取列

4、dataframe转Tensor报错:ValueError: expected sequence of length 10 at dim 0 (got 16000)指定文件中没有列名(header)。index_col = 0将第一列作为索引列。sep指定读取的时候分隔符的标点,一般有‘,’,‘\t’这两种。2、分别代表列名称和行名称:df.columns, df.index。2、df.iloc 进行切片操作。1、pandas读取csv文件。3、遍历每个表格中的元素。

2024-02-21 09:20:01 242 1

原创 Rds数据格式转换成python可以读取和处理的数据格式

之后就可以在python中进行正常的csv文件操作方式了,见本人其他博客。

2024-02-19 11:51:46 273

原创 有关python代码的常见错误都在这里,生信数据加载,网络训练,并行分布式,持续更新中

在base下搜索之后找到缺失的py文件’_sysconfigdata_x86_64_conda_linux_gnu’复制将此文件复制到丢失文件的环境下,解决了我的问题。

2024-01-16 15:42:25 868

原创 CCLE药物敏感性及基因表达数据下载方法

点击datasets,然后选择Broad_Depmap_data,选择自己需要的数据类型然后选择下载,这里我选择了counts数据。

2023-12-15 11:20:14 615

原创 EndnoteX系列使用方法大全及GBT7714参考文献格式下载

划重点:后两个格式文件下载后务必要放在EndNote_X8_Windows-1\Styles下面,否则无法使用该格式,双击进行格式初始化,关闭后即可使用了。之后要微调格式都在这个界面修改就可以了。1、光标停在要插入文献的位置。2、选择参考文献style。3、选择插入的文献并确定。

2023-04-14 11:25:21 590

原创 清华专业学位硕士论文[word97-2003兼容版本]格式调整踩坑记录

提前需要将每一章和每一节的标题设置好,再设置目录的格式。如果出现下边的情况,则需要用Tab键将“…”显示出来,在文字和数字之间按下“Tab”键即可。对于每个标题都要通过这种方式进行样式设置,选中待改格式的区域,点击相应的样式即可更改。(需要点开下图中紫色的文章题目,在期刊中找到对应的引文方式(更改后,选中有文献编号变更的原文段落,右键。选中需要插入的文档,将文档导入当前文档中。(2)如果想更换页码的编码方式,采用。(2)正文随时添加/删减文献。输入参考文献标题,回车,点击。即可实现文献超链接。

2023-03-16 21:06:56 667 1

原创 python编辑器找不到代码路径

使用vscode的小伙伴可能会发现在同一目录下的文件夹内的文件相互之间是不可见的,如何在当前。差查那么多,最后这个方法可以轻松搞定!文件下调用另一个文件夹下的文件呢?

2023-03-06 09:58:39 134

原创 opencv /PIL /plt 画图技巧总结-毕业论文

opencv /PIL /plt 画图技巧总结-毕业论文

2023-03-04 11:07:55 207

原创 Python常用文件操作方法大全, csv,json,xlsx...传输scp 复制cp

2、json文件保存方式。1、csv文件保存方法。3、保存xlsx文件。

2022-11-09 21:21:37 469

原创 PDF以及PPT技巧

福昕调整PDF页面大小方法

2022-08-30 22:19:55 569

原创 Semantic Image Synthesis with Spatially-Adaptive Normalization阅读

解读链接:SPADE 论文阅读–Semantic Image Synthesis with Spatially-Adaptive Normalizationhttps://zhuanlan.zhihu.com/p/61457287其中复习一下:SPADE——SPatially-Adaptive DEnomalization 空间自适应去归一化示意图https://blog.csdn.net/jacke121/article/details/90749274...

2022-06-27 14:26:49 244

原创 Pycharm 进入DataLoader之后出现无法debug的情况

不要慌,说明你的数据分配的工作进程过多。将DataLoader中的设置改成0即可。https://blog.csdn.net/weixin_43593330/article/details/107483671

2022-06-01 21:50:13 374

原创 Pycharm如何上传到Git

Pycharm如何上传到Git1、新的工程左下角有“git”字样,首先点击“git”字样2、创建git本地仓库3、项目根目录右键后选中“git”,然后点击“Add”,当前代码添加到git仓库4、添加到“git”仓库后的代码需要确认路径,还是项目根目录右键后选中“git”,然后点击“commit Directory”, 这一步操作之后,文件从绿色变成白色5、最后在当前项目的目录下输入:git remote add 名称(随便起) http://git.mymooc.top/ges/pytor

2022-04-19 23:03:37 735

原创 关于pycharm远程连接服务器的傻瓜时间

关于pycharm远程连接服务器的傻瓜时间今天特别惨因为pycharm专业版过期没及时激活导致pycharm直接崩了!!!太坑了,我必须要告诉大家,教育邮箱注册的pycharm是可以在同学之间共享账号的,所以没关系只要借个账号我还是一条憨憨~正常人按照大佬写的一步步去做应该没问题Pycharm设置远程服务器运行环境但是总有人像我一样盲目自信,忽略细节:大佬的files->settings->Python Interpreter版本是这样的:最新版2021.3的界面是这样的:其他

2022-03-24 23:12:33 1000

原创 Latex编辑大全

1、首先是基本的一些公式编辑器里面都有的符号的编辑Latex各种命令、符号、公式、数学符号 等常用数学符号的 LaTeX 表示方法2、编辑表格基本表格绘制特殊格式设置表格技巧记住一个:调表格宽度:\begin{tabular}{| p{2cm}| p{1.7cm}| p{2.2cm}| p{1.7cm}| p{2cm}|p{2cm}|}3、编辑图片图片转 .eps格式最好用的办法4、编辑公式Latex各种命令、符号、公式、数学符号 等其中,推荐行内使用$ $,行间使用\begin

2022-02-25 18:38:21 698

原创 RuntimeError: CUDA error: device-side assert triggered

RuntimeError: CUDA error: device-side assert triggeredCUDA kernel errors might be asynchronously reported at some other API call,so the stacktrace below might be incorrect. For debugging consider passing CUDA LAUNCH BLOCKING=1pytorch/aten/src/ATen/native

2021-12-09 14:59:26 1777

原创 type(torch.LongTensor)报错有关不同变量分别在cpu和cuda下

变量名.type()转换tensor类型的时候注意!!!torch.cuda.LongTensor:加载到GPUtorch.LongTensor:加载到CPU官网其他转换类型model.cuda()input_iter = Variable(torch.tensor(input_iter))input_iter = input_iter.type(torch.cuda.LongTensor)output = model(input_iter)...

2021-12-09 11:05:46 3165

原创 pip / conda有关 “解释器错误: 没有那个文件或目录” 的解决办法

本人参考这位大佬的文章,并加了自己的填坑过程。anaconda无法激活新建环境,提示没有那个文件或目录:路径问题1、执行 conda activate base(激活环境)等等于conda相关命令时,会报一个关于路径找不到的错误。这种问题一般的解决方法就是到报错的路径下看看有没有这个东东,没有当然会报错。例如我执行:(ges) ges@gpu-1:~$ pip install prepro报错:-bash: /home/ges/anaconda3/envs/ges/bin/pip: /home

2021-12-07 22:45:29 5587 4

转载 各种深度学习模型权重下载链接

https://blog.csdn.net/lxy_2011/article/details/97488494添加链接描述

2021-11-29 13:56:14 665

原创 如何在pytorch中实现tf.random.shuffle的功能

想多了,只能用random.shuffle代替介绍几个常用的函数:1、tf.tile – > np.tilenp.tile表示将一个序列或者矩阵沿着某一轴复制多少次:np.tile(array, (1,2))下面两个操作的返回值类型不同,实现功能相同:注意127和128的区别,range 和 arange 的区别main_shuffle = torch.tile(torch.range(0, 127), [4])main_shuffle = np.tile(torch.arange(

2021-11-25 10:20:10 1494

原创 CUDA常见错误

RuntimeError: CUDA error: device-side assert triggered运行超时报错通常原因是内存不够,需要将网络的batch_size调小。CUDA10.2没有对应版本的tensorflow-gpu这个至今尚未解决,希望解决的小伙伴麻烦评论区能告知一下,感谢!...

2021-11-24 17:18:04 1513

原创 一些复现代码的小技巧

写在最前面:运行自己能看懂的代码!!!人家的代码都是封装的很好的代码,只需要修改参数就可以通过命令行直接运行,但是这可能会出现“sh”不是内部命令等等一系列错误。所以我们要运行的就是main.py文件或者train.py文件,这对于代码能力不是很强的人来说是一条捷径。运行成功之后就需要我们修改参数,然后进行进一步学习了。错误集锦找不到路径问题解决方法1、终端的路径认为是根目录,而不是代码train.py所在的目录,这一点牢记!2、想要把代码运行(终端)目录上一级的东西导入进当前代码可以通过s

2021-11-22 14:03:46 3059

原创 linux下采用命令行杀死进程的两个方法

找到进程并杀死方法1:ps aux # 查看正在运行的进程号ps aux | grep chrome # 杀死与chrome相关的进程kill -9 进程ID方法2:fuser -v /dev/nvidia*kill -9 进程ID

2021-11-22 09:43:14 535

原创 torch.nn.parallel.DistributedDataParallel分布式训练踩坑记录

大佬文章注意:使用torch.nn.parallel.DistributedDataParallel对模型操作以前需要先将模型加载到device上。model = model.to(device)model = DDP(model, device_ids = [args.local_rank], output_device = args.local_rank, find_unused_parameters =True)...

2021-11-18 13:06:49 2955 1

原创 torch.softmax踩坑记录

使用torch.softmax会将原本torch.Size([2, 4, 2])的张量变成torch.Size([8, 2]),改成torch.nn.functional.softmax则不会改变张量维度,但是要记得指定softmax计算的维度torch.nn.functional.softmax(outputs, dim=-1)

2021-11-18 09:58:07 1071 1

转载 int/list类型转tensor类型

python数据类型->Numpy数据类型->Pytorch的cup tensor->Pytorch的gpu tensor转载a为基本的int类型数据b=np.array(a), b为numpy数据类型c=torch.from_numpy(b),c为CPU的tensord=c.cuda(),d为GPU的tensor

2021-11-17 20:09:53 15069

原创 Docker 不完全踩坑记录

Docker 不完全踩坑记录docker 基本命令docker+pycharm远程debug本地文件操作编辑文本的小技巧docker 基本命令在远程服务器base上进行如下操作:# 一下含有new字样的都是自己起名字的停止:docker stop Name或者ID 启动:docker start Name或者ID (如果attach容器突然发现自己的容器内部东西为空,只要重新start一下再attach即可)杀死:docker kill Name或者ID 移除:docker rm -f Na

2021-11-17 19:58:55 612

转载 模型的参数及计算量

卷积和全连接层参数量计算公式:转载卷积层参数量=(filter size * 前一层特征图的通道数 )* 当前层filter数量+当前层filter数量全连接层的计算量 = 映射的特征图大小(77512)*输出一维向量的维度(4096)假设输入神经元数为M,输出神经元数为N,则:(1)bias为True时:则参数数量为:M*N + N(bias的数量与输出神经元数的数量是一样的)(2)bias为False时:则参数数量为:M×N卷积层的FLOPs:乘法次数=输出特征图的大小(Hout *

2021-06-21 11:41:18 968

转载 深度可分离卷积和普通卷积的本质区别

深度可分离卷积和普通卷积的本质区别转载原本的卷积与深度可分离卷积区别:原本的卷积是各个通道上采用相同的卷积核,然后不同的卷积核用于提取不同方面的特征。深度可分离卷积先在各个通道上采用不同的卷积核提取不同的特征,但是这样对于某个通道来说,就只提取了一方面的特征,因此在此基础上加入点卷积,用1*1的卷积对提取特征后的特征图再次提取不同方面的特征,最终产生和普通卷积相同的输出特征图。好处是这样做大大节约了参数量。...

2021-06-21 09:52:24 2806 3

原创 开始一个分割任务pytorch-unet

Pytorch实践——先胡乱开始一个项目1、Data文件夹用于保存数据;2、Checkpoint文件夹用于保存训练过程中的权重文件;3、Log文件夹用于存放训练日志,如Loss和准确率变化曲线等等;4、utils.py用于定义一些自定义的子函数,具体内容因项目而异;5、config.py用于一些参数设置,如数据读入路径、学习率大小、迭代步长等等。6、network(.py)用于定义网络结构。之所以加括号是因为network有时候是一个文件夹(或者说包),因为在网络结构比较复杂的时候,我们采用多

2021-04-12 09:36:40 654

原创 Pytorch 基础入门

Pytorch 基础入门1.Pytorch常用包:[https://blog.csdn.net/qq_43270479/article/details/104077232]2.PyTorch系列 (一): pytorch使用总览:https://likewind.top/2019/01/17/Pytorch-introduction/PyTorch系列 (二): [pytorch数据读取:https://likewind.top/2019/02/01/Pytorch-dataprocess/]Pyt

2021-02-01 20:30:07 105

空空如也

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