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RSS订阅原创 浅谈GWAS分析后的富集分析操作（GO/KEGG）
浅谈GWAS分析后的富集分析操作（GO/KEGG）作者：刘济铭########################在我们完成全基因组关联分析后，常常筛选得到特定性状的基因集，接下来，通常我们需要开展富集分析，筛选显著的基因功能富集和Pathway，这就要用到GO富集和KEGG富集。理论和结果解释同样在知乎和各平台有很多讲解，因此，我还是重点提供一个富集分析的R脚本，供大家交流学习。###GO富集分析R脚本#加载OrgDB包，OrgDB目前只有少数模式物种有公共数据库，通常大家研究的物种均已经建立了
2022-04-23 14:06:35
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原创 GEMMA 全基因组关联分析+CMplot多性状曼哈顿+QQ图脚本
这里写自定义目录标题GEMMA 全基因组关联分析+CMplot多性状曼哈顿+QQ图脚本GEMMA 全基因组关联分析+CMplot多性状曼哈顿+QQ图脚本###GEMMA 全基因组关联分析+CMplot多性状曼哈顿+QQ图脚本#作者：刘济铭##########################GWAS理论和基本结果理解已经有很多大神进行了解读，因此不再赘述，想要学习请移步知乎或各大基因课平台学习。本人发现目前缺乏具体实用脚本，因此本帖只提供本人脚本供大家交流学习，本人脚本不是最好肯定也会存在问题，请大
2022-04-23 12:10:25
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原创 SDMtoolbox 2.0 基于MaxEnt的快捷指令ArcGIS工具包简介
SDMtoolbox 2.0 基于MaxEnt的快捷指令ArcGIS工具包简介开门见山，大家既然可以关注到 SDMtoolbox 的应用，想必应该已经对生态位模型这一方面的理论有所了解，因此本文不再赘余，只讲干货，不懂或有问题的地方，请大家留言探讨，共同进步。SDMtoolbox 是基于ArcGIS系统的加载功能包，其算法和原理均来源于Phillips发表的生态位模型：最大信息熵模型（MaxEnt）。即利用物种空间分布数据的气候、地形、土壤等生态因子与研究区域的非随机关系，在满足一定限制条件的情况下，找
2020-07-16 18:17:36
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SDMtoolbox_2_10_4to6.zip
2020-07-16
世界各国高清地图+世界高清行政区划图+中国超清行政区划图+高清中国南方各省县级区划图.zip
2020-02-19
GloElev_5min.zip
2020-02-15
worldclimte 全球70-00年生物气象数据.zip
2020-01-30
中国1-5级河流，全国水系矢量图，行政区界（包含国界，省界，县界），主要交通道路（公路、铁路），居民地分布.zip
2020-01-30
空空如也
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