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RSS订阅翻译 MetaboanalystR离线安装历程
MetaboanalystR离线安装历程做过代谢组学数据分析的人应该对这个常用的在线数据分析网站不陌生了吧，研究生阶段的时候认为可以用在线版解决问题的软件就没有管，后来发现自己没有什么进步，今天主要是给大家看一看线下版MetaboanalystR在Rstudio上安装时遇到的一些小问题吧！安装环境：Window 7RstudioR version:3.6.31.安装相应的依赖包metanr_packages <- function(){ metr_pkgs <- c("imp
2020-08-21 14:05:48
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原创 GC-MS图谱数据前处理
上一篇博客的内容比较适合LC-MS数据前处理，基于GC-MS的图谱前处理也可以通用，但是效果不好，在接触了2016年开发的erah包，毅然决然的选择了这种方法进行GC-MS 数据的前处理。R版本依然是3.6以上同样的也是先将.raw文件转换为.mzXML文件安装包和载入，此包安装需要很多依赖包，它会自行安装install.packages("erah")library(erah)创建CSV文件在数据文件夹，具体的自行替换createdt("D:/XSHPCOS1/")ex <-
2020-07-30 17:26:26
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原创 组学数据图谱前处理
由于经常遇到坑，其他方法也有局限性，选择了这种方法的原始数据处理，里面的参数还需要根据实际图谱进行调整。基于R的XCMS包进行图谱原始数据额处理，版本3.6以上 安装XCMS包，最新的版本if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))install.packages("BiocManager")BiocManager::install("xcms")Library(XCMS)导入数据，原始数据是.RAW文件，需转换为mzXML
2020-07-29 18:00:35
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空空如也
空空如也
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