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RSS订阅原创 AMBER18&AMBERTOOLS18安装-linux系统
1.准备好amber18以及ambertools18压缩包将两个压缩包在linux中解压缩tar -xf Amber18.tartar -xf AmberTools.tar这两个文件会都解压至同一个Amber18文件夹中2.设置环境变量nano ~/.bashrc 打开bashrc文件在里面加入Amber18的安装路径export AMBERHOME=/home/liwen/amb...
2019-11-16 17:16:08
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原创 autodock-vina分子对接
autodock-vina分子对接1.蛋白质的处理从蛋白库里获取蛋白质的初始结构文件http://www.rcsb.org/这里我们选用3HTB蛋白复合物文件，用可视化软件打开pdb文件，这里选用pymol软件查看我们去除掉水分子以及配体，在右侧3htb中点A，选择remove waters ，再点中右下角S，拖动序列栏，在序列栏中选中其他小分子配体，在右侧sele中点A，选择remov...
2019-11-12 19:33:23
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Amber18.tar
The Amber18 package builds on AmberTools18 by adding the pmemd program, which resembles the sander (molecular dynamics) code in AmberTools, but provides (much) better performance on multiple CPUs, and dramatic speed improvements on GPUs.
2019-11-16
空空如也
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