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原创 VASP - Bader Charge Analysis

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2020-07-31 18:03:31 10167

原创 vasp-自旋轨道耦合(SOC)计算步骤

在VASP中执行自旋轨道耦合(SOC)计算,具体的计算步骤如下:结构优化获取CONTCAR文件 自洽计算(collinear normal VASP calculations)获取IBZKPT,CHGCAR和WAVECAR文件。 SCF+SOC计算,在此步骤中,将步骤2中的IBZKPT复制为KPOINTS,以便两个步骤具有相同的k网格,因此可以读取步骤2中的CHGCAR和WAVECAR文件。 能带结构计算,在此步骤中,将KPOINTS改为高对称点,读取步骤3中的CHGCAR和WAVECAR文件。

2020-07-30 00:28:52 23557 2

原创 vasp-电荷局域密度图(ELF)

以Graphene为例:INCAR: 添加LELF = .TRUE.SYSTEM = grapheneISTART = 0ICHARG = 2#Startparameter for this run:PREC = A #Electronic Relaxation ENCUT = 500NELM = 60NELMIN = 6NELMDL = -12 EDIFF ..

2020-07-29 15:19:09 22995 3

原创 使用lev00生成电荷密度等高图

以graphene为例:INCAR:SYSTEM = sysISTART = 0ICHARG = 2#Startparameter for this run:PREC = A #Electronic Relaxation ENCUT = 500NELM = 200EDIFF = 1E-6 LREAL = F ALGO = Normal#DOS related

2020-07-29 11:28:50 1171 1

原创 vasp-Lev00编译

LEV00 - a useful tool for various DFT codes (VASP, SIESTA, CASTEP, QUICKSTEP)Lev00 虽然有很多不同的功能,但是我们一般只用它处理电荷密度,来生成更容易理解的科研绘图。例如:如何安装LEV00? 下载LEV00,下载链接为:https://nms.kcl.ac.uk/lev.kantorovitch/codes/lev00/index.html 安装过程: tar zxvf lev00.

2020-07-26 11:00:47 1051

原创 centos 7 安装svn服务器

1. # yum -y install subversion !安装2. # mkdir -p /data/svn !建svn版本库目录3. # svnadmin create /data/svn/wwqian !建立自己的admin(wwqian换成任意名称)4. # vi /data/svn/wwqian/conf/passwd5. # vi /data/svn/wwqian...

2020-01-05 01:14:23 209

原创 Anaconda常用命令

#取消开机加载虚拟环境conda config --set auto_activate_base false#查看版本信息conda --version#更新condaconda update conda#查看当前环境下的软件包conda list#显示已创建环境conda info --envs#创建环境conda create --name python3 p...

2020-01-05 01:09:27 172

原创 CentOS 7 安装anaconda3

1. # wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh !获取Anaconda3软件包2. # bash Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh !根据提示输入完成安装(Enter-Enter-yes-Enter)3. # yes !初始化设置Anacon...

2019-12-24 00:03:01 201

原创 CentOS 7 安装python3.8

安装python3.81. # wget https://www.python.org/ftp/python/3.8.1/Python-3.8.1.tgz !获取Python软件包2. # tar -zxvf Python-3.8.1.tgz !解压3. # cd Python-3.8.14. # yum -y install libffi-devel zlib-devel ...

2019-12-23 23:42:52 2519

原创 超算平台下利用module加载相关模块

environment-modules是一个用于管理用户不同应用的工具,可以动态的加载、移除所安装的应用。1. 对于root用户的安装命令:(需要管理员权限,普通用户无法安装)# sudo yum install -y environment-modules2.设置环境变量:安装environment-modules之后,会默认在/usr/share/module目录下产生一系...

2019-12-23 17:36:11 5777 2

原创 CentOS 更新yum国内源

CentOS,是基于 Red Hat Linux 提供的可自由使用源代码的企业级 Linux 发行版本;是一个稳定,可预测,可管理和可复制的免费企业级计算平台。配置方法:1. 备份# mv /etc/yum.repos.d/CentOS-Base.repo /etc/yum.repos.d/CentOS-Base.repo.backup2. 下载新的 CentOS-Base.re...

2019-12-23 16:29:49 149

原创 CentOS 7 设置静态IP地址及远程连接

如何设置静态IP地址?1. 在CentOS 7 中,ifconfig命令不可以直接使用,可以安装ifconfig命令:# yum search ifconfig!查询相关命令的包# yum install net-tools!安装net-tools工具包或者利用其它命令查看IP的分配情况:# ip addr2. 在修改网络配置之前需要root权限,即使用root...

2019-12-23 12:45:33 743

原创 vasp-phonopy编译

如何编译phonopy安装python,详情见https://blog.csdn.net/qwxwaty/article/details/103126287 安装Anaconda,详情见https://blog.csdn.net/qwxwaty/article/details/103130618 下载phonopy code,官网http://atztogo.github.io/phono...

2019-11-19 11:23:48 1298

原创 Ubuntu下安装anaconda3

查看Ubuntu是32位还是64位。 下载anaconda3,https://www.anaconda.com/distribution/#download-section 或者直接输入,wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh bash Anaconda3-xxx-Linux-x86_6...

2019-11-18 21:23:17 410

原创 Ubuntu安装python3.7

在Ubuntu-18.04 LTS中,python默认为3.6版本。如果直接使用sudoapt-get install python3.7命令进行安装,则安装会失败。安装python3.7输入wgethttps://www.python.org/ftp/python/3.7.5/Python-3.7.5.tgz 解压tar -zxvfPython-3.7.5.tgz 输...

2019-11-18 20:35:33 1307

原创 Ubuntu 更新源方法(适用于大多数版本)

进入终端 显示文件 输入cd ../.. ;找到/etc/apt目录 输入cd etc/apt 找到sources.list文件 备份,sudo cpsource.listsource.list.old(修改配置文件需要管理员权限,如果不加sudo,无法备份) 修改source.list文件,输入sudo visource.list 删除全部内容,可用vi命令dG(删除光标所...

2019-11-18 16:16:49 769

原创 史上最全的机器学习、人工智能学习资料

仅做个人学习交流,如有版权问题,请及时联系本人删除~链接: https://pan.baidu.com/s/1TSU6Rs2cLWqI2IyNOE2mxQ 密码: qd3c相关学习路线见另一篇文章:https://blog.csdn.net/qwxwaty/article/details/80793370...

2018-06-25 13:36:25 7081 222

原创 史上最权威的人工智能网站推荐

美国人工智能协会(American Association for Artificial Intelligence网址: http://www.aaai.org/)美国人工智能协会(AAAI)成立于1979年,是个非盈利性的科学社团组织,主要致力于让机器产生智慧思考和智能行为的研究。此外,提升公众对人工智能的理解,对人工智能实践人员的教学和培训,为人工智能领域的研究者和投资者提供指导等也都是AAA...

2018-06-24 18:49:12 3626

原创 人工智能学习路线

阶段一、人工智能基础 - 高等数学必知必会本阶段主要从数据分析、概率论和线性代数及矩阵和凸优化这四大块讲解基础,旨在训练大家逻辑能力,分析能力。拥有良好的数学基础,有利于大家在后续课程的学习中更好的理解机器学习和深度学习的相关算法内容。同时对于AI研究尤为重要,例如人工智能中的智能很大一部分依托“概率论”实现的。一、数据分析1)常数e2)导数3)梯度4)Taylor5)gini系数6)信息熵与...

2018-06-24 18:47:53 39600 171

原创 史上最权威的人工智能学习网站推荐

AI学习资源推荐原则权威:本文介绍的课程都是由国内外知名企业或高校推出的,课程内容的权威性、前沿性有保障。免费:课程基本都是免费的,就算收费也是象征性收1元那种。正版:所有课程资源都是发布者通过正规渠道发布的,而不是有些营销号那样收集很多收费课程的视频,通过病毒营销的方式传播。实用:我选的课程都是那种有代码的,你可以动手写程序实践。没有选那种只讲理论或者技术过于超前的课程。针对人群想进入人工智能领...

2018-06-24 18:23:38 28805

原创 100多个微信小程序代码免费送

所有资源均来自互联网公开渠道搜集,仅供学习交流之用,版权归原作者所有。链接: https://pan.baidu.com/s/1PyFC-v9bDdZRBsVXJwyalg 密码: 8834补充:微信小程序官方Demo(Hao-Wu/WeApp-Demo)微信小应用示例代码(phodal/weapp-quick)微信小应用地图定位demo(giscafer/wechat-weapp-mapdemo...

2018-06-24 17:49:14 8059 1

原创 Error running '***'错误解决方案

在pycharm等IDE集成开发环境中出现以下错误时,即Error running '***': Cannot run program "C:\Users\Administrator\PycharmProjects\*****\venv\Scripts\python.exe" (in directory "C:\Users\Administrator\PycharmProjects\*****")...

2018-06-16 09:52:44 41691 4

原创 Materials Studio工具模块介绍

各模块细节介绍:•Materials Visualizer:Materials visualizer 是Materials Studio 的图形化界面,也是整个平台的核心,可用于:• 搭建、调整各类三维可视的结构模型,包括晶体、小分子、聚合物、 纳米材料、团簇、表界面、各种缺陷结构以及电极模型;• 提供模块参数设置、结果分析的视窗界面;提供结构文件、参数文件以及结果文件的管理界面;提供计算进程的...

2018-06-13 15:38:17 30563

原创 Materials Studio模块介绍

Visualizer Tools:可视化工具操作界面对用户友好,通过可视化窗口完成一系列的命令,诸如建立特定的晶体、聚合物、表面、层和界面建模。Adsorption Locator:吸附定位工具研究不同性质吸附基板上吸附不同类型吸附质的位置关系。原理:吸附定位器模拟装载有固定组分的吸附物或吸附物混合物的基底,可以在周期性和非周期性底物上找到低能量吸附位点,或研究吸附物组分混合物的优先吸附。 根据模...

2018-06-13 11:07:51 8621 2

原创 Materials Studio 软件下载

Materials Studio 破解版软件下载链接: https://pan.baidu.com/s/149fDvYDaES2lV81ZojhMXQ 密码: dmss

2018-06-13 00:28:30 16566 24

原创 Linux基本命令总结

一、Linux权限 Linux下有两种用户:普通用户:在linux下做有限的事情; 超级用户:可以在linux系统下做任何事情,不受限制。 普通用户的提示符是“$”,超级用户的命令提示符是“#”。 命令: su [用户名] 功能:切换用户 Linux权限管理 1.文件访问者的分类文件和文件目录的所有者:u—User 文件和文件目录的所有者所在的组的用户:g—Group 其他用户:o—Others ...

2018-06-08 10:38:00 511

原创 python中str常用操作

1) 判断类型 - 9方法说明string.isspace()如果 string 中只包含空格,则返回 Truestring.isalnum()如果 string 至少有一个字符并且所有字符都是字母或数字则返回 Truestring.isalpha()如果 string 至少有一个字符并且所有字符都是字母则返回 Truestring.isdecimal()如果 string 只包含数字则返回 Tr...

2018-05-28 11:36:05 801

原创 python中list常用操作

序号分类关键字 / 函数 / 方法说明1增加列表.insert(索引, 数据)在指定位置插入数据  列表.append(数据)在末尾追加数据  列表.extend(列表2)将列表2 的数据追加到列表2修改列表[索引] = 数据修改指定索引的数据3删除del 列表[索引]删除指定索引的数据  列表.remove[数据]删除第一个出现的指定数据  列表.pop删除末尾数据  列表.pop(索引)删除指...

2018-05-28 11:34:57 232

原创 python写代码易错点

input()函数:用户输入的任何内容在Python中都认为是一个字符串

2018-05-26 14:34:22 430

原创 python错误类型解析(bug)

NameError: name '*****' is not defined:名称错误,可能是由于手误或者没有引用库所造成的系统无法识别某些具体的函数。SyntaxError: invalid syntax:语法错误,语法无效,一般是由于将多个任务写在同一行之中,违背了每行代码负责一个任务原则。IndentationError: unexpected indent:缩进错误,一般是由于缩进不恰当。...

2018-05-25 15:29:20 421

原创 python实现词频统计

import stringpath1='/Users/Administrator/Documents/Walden.txt'path2='/Users/Administrator/Documents/result.txt'with open(path1,'r',encoding='UTF-8') as text,open(path2, 'w',encoding='UTF-8')as file...

2018-05-24 20:02:07 1173

原创 python 3教程 学习(1)

python保留字类型int (整数)bool (布尔)float (浮点数)complex (复数)str(字符串)行与缩进缩进的空格数是可变的,但是同一个代码块的语句必须包含相同的缩进空格数。...

2018-05-22 11:25:53 297

原创 python 3教程 学习(2)

Python3 运算符算术运算符比较运算符赋值运算符位运算符逻辑运算符成员运算符innot in身份运算符身份运算符用于比较两个对象的存储单元is 是判断两个标识符是不是引用自一个对象is not 是判断两个标识符是不是引用自不同对象运算符优先级...

2018-05-22 11:25:46 155

原创 python 3教程 学习(3)

只记常用的。数学函数函数返回值 ( 描述 )abs(x)返回数字的绝对值,如abs(-10) 返回 10ceil(x)返回数字的上入整数,如math.ceil(4.1) 返回 5 exp(x)返回e的x次幂(ex),如math.exp(1) 返回2.718281828459045fabs(x)返回数字的绝对值,如math.fabs(-10) 返回10.0floor(x)返回数字的下舍整数,如mat...

2018-05-22 11:25:38 211

原创 python 3教程 学习(4)

Python列表脚本操作符列表对 + 和 * 的操作符与字符串相似。+ 号用于组合列表,* 号用于重复列表。如下所示:Python 表达式结果描述len([1, 2, 3])3长度[1, 2, 3] + [4, 5, 6][1, 2, 3, 4, 5, 6]组合['Hi!'] * 4['Hi!', 'Hi!', 'Hi!', 'Hi!']重复3 in [1, 2, 3]True元素是否存在于列表中...

2018-05-22 11:25:24 163

原创 python 3教程 学习(5)

循环语句while 循环for 语句break和continue语句pass 语句条件控制if 语句

2018-05-22 11:25:06 147

原创 python 3教程 学习(6)

迭代器迭代器是一个可以记住遍历的位置的对象。迭代器对象从集合的第一个元素开始访问,直到所有的元素被访问完结束。迭代器只能往前不会后退。迭代器有两个基本的方法:iter() 和 next()。字符串,列表或元组对象都可用于创建迭代器:生成器在 Python 中,使用了 yield 的函数被称为生成器(generator)。跟普通函数不同的是,生成器是一个返回迭代器的函数,只能用于迭代操作,更简单点理...

2018-05-22 11:24:53 213

原创 python 3教程 学习(7)

数据结构Python中列表是可变的,这是它区别于字符串和元组的最重要的特点,一句话概括即:列表可以修改,而字符串和元组不能。以下是 Python 中列表的方法:方法描述list.append(x)把一个元素添加到列表的结尾,相当于 a[len(a):] = [x]。list.extend(L)通过添加指定列表的所有元素来扩充列表,相当于 a[len(a):] = L。list.insert(i, ...

2018-05-22 11:24:17 193

原创 Materials Studio教程(中科大)

目录第0章 绪论 10.1 计算机材料设计的概念 10.2 计算机材料设计的发展 10.3 计算机材料设计的途径 2第1章 快速启动教程 11.1 创建项目(Creating a project) 11.2 打开、浏览3D文档 21.3 绘制苯甲酰胺(benzamide)分子 41.4 用学习表文档进行浏览和工作 81.5 研究分子晶体:尿素 111.6 建立α-quartz晶体 121...

2018-05-22 10:43:44 69599 132

原创 python内建函数大全(built-in functions)

python官网上的英文介绍:https://docs.python.org/3/library/functions.html  Built-in Functions  abs()dict()help()min()setattr()all()dir()hex()next()slice()any()divmod()id()object()sorted()ascii()enumerate()input...

2018-05-20 23:24:38 5581

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