root_lty-CSDN博客

转载 msvcr120.dll 重新安装服务

当我win10的新台式机装wampserver的时候突然出现了一个之前没有遇到的报错（安装的时候报错），如下所示：找不到msvcr120.dll,需要重新安装服务找打了一位大佬自己做的修复软件（这个软件可以在大佬原文的百度云盘中，也在作者我本人的云盘里）：出现这个问题最主要的原因就是本地c++ 库组件有问题。最后我找到了解决方案，就是下载一个 DirectX修复工具，然后使用该软件进行修复即可如果在修复的过程中，发现你本地已经安装过c++组件，把本地的卸载掉，在重试下即可传送门： D

2020-07-05 19:19:53 1025

原创 line 1213 did not have 4 elements

read.table中有一个参数 comment.char = “”默认情况下，read.table 用 # 作为注释标识字符。如果碰到该字符（除了在被引用的字符串内），该行中随后的内容将会被忽略。只含有空白和注释的行被当作空白行。如果确认数据文件中没有注释内容，用 comment.char = “” 会比较安全（也可能让速度比较快）。例子：我的文件中他默认的时候是#以后的内容被注释了，因此读入的时候一直报错因此如果确认数据文件中没有注释内容，用 comment.char = “” 就不会

2020-07-03 10:24:35 4729

原创 XML包安装之 ERROR: configuration failed for package ‘XML’

安装XML时候报错如下所示：安装相应的libxml2-devel的环境就好，我的系统是centos，Ubuntu的话应该是ibxml2-dev

2020-06-25 12:23:36 4774 1

原创 pubmed搜索基因的小技巧

PubMed中搜一个基因比如“P53”然后你会发现下面出现了一个基因的信息框，其中会显示出这些信息：1）P53基因和功能相关的8770篇文献2）NCBI的Gene数据库中的数据3）不同物种的P53基因点击到Gene的数据库的话，然后点击人类的P53，就进入了这样熟悉的Gene的界面。当然，在这样的Gene的界面中，我们仍然可以找到PubMed。就在右侧的Related Information这一栏下面：PubMed、PubMed（GeneRIF）、PubMed（OMIM）和PubMed（

2020-06-21 20:52:19 7246 1

原创 R 读入fastq文件

##--构建函数--##seq_import <- function( file ){ seq <- readLines(file) # 读入序列，每个元素存入一行 seq <- seq[seq != ""] # 去除空行 is.anno <- regexpr("^>", seq, perl=T) # 正则匹配（regular expression）注释行,是注释行为1，否则为-1 seq.anno <- seq[ which(is.anno == 1)

2020-06-21 17:03:47 4792 1

原创基于负二项分布模拟基因表达谱

1. RNA-seq为什么是负二项分布？2.负二项分布解释3.DESeq2基于负二项分布找差异基因4.生物信息学基础知识15.生物信息学基础知识26.广义线性回归模型7.广义线性回归模型...

2020-03-26 16:25:29 1778 1

原创 Rmarkdown 报错：无法打开链接

这个bug在于R markdown不能找到源文件。你把文件的路径在Markdown里先指定一下。setwd(“…”)

2020-03-02 09:35:03 4142

原创 set.seed的作用

#set.seed()产生随机数#用于设定随机数种子，一个特定的种子可以产生一个特定的伪随机序列，这个函数的主要目的，#是让你的模拟能够可重复出现，因为很多时候我们需要取随机数，但这段代码再跑一次的时候，#结果就不一样了，如果需要重复出现同样的模拟结果的话，就可以用set.seed()。ng=500 nc=20set.seed(123456789)head(rnorm(ng*nc))...

2020-02-05 14:39:39 7099 2

原创 NLP 之 transformer

1 Transformer模型Transformer由论文《Attention is All You Need》提出，现在是谷歌云TPU推荐的参考模型。Transformer模型是2018年5月提出的，可以替代传统RNN和CNN的一种新的架构，用来实现机器翻译，论文名称是attention is all you need。无论是RNN还是CNN，在处理NLP任务时都有缺陷。CNN是其先天的卷积...

2020-01-10 10:53:07 596

原创高斯混合聚类

1.高斯混合聚类https://blog.csdn.net/lotusng/article/details/799907242.最大似然估计http://fangs.in/post/thinkstats/likelihood/https://blog.csdn.net/u014182497/article/details/822524563.代码链接https://blog.csdn.n...

2020-01-09 22:56:57 201

原创 AlphaStar

RNN1.https://www.jianshu.com/p/95d5c461924cAlphaStar1.https://zhuanlan.zhihu.com/p/557816142.https://zhuanlan.zhihu.com/p/560436463.https://zhuanlan.zhihu.com/p/92543229

2020-01-08 16:48:23 675

原创 RPKM, FPKM, TPM ????

https://www.jianshu.com/p/2bfa2b65a700https://www.jianshu.com/p/9dfb65e405e8https://www.bioinfo-scrounger.com/archives/342/https://blog.csdn.net/herokoking/article/details/78790938

2019-12-31 12:21:20 681

原创 EXCEL

#1 G列中对应到A列，匹配到返回对应的B列的值=INDEX(B:B,MATCH(G2,A:A,0))

2019-11-19 14:51:26 76

原创 selenium Chrome和Firefox使用

1 Chrome（exe模拟窗口软件下载）http://chromedriver.storage.googleapis.com/index.html2 Firefox（exe模拟窗口软件下载）https://github.com/mozilla/geckodriver/releases3 复制EXE到指定目录把下载好的chromedriver.exe 或者 geckodriver.exe...

2019-11-09 10:25:21 464

原创查看函数R包

clusterProfiler::然后 table 键，然后就出现所有的函数方法然后这些都是explore过的函数，可以直接clusterProfiler::bitr() 调用但是有些未公布的函数，比如内部定义的函数，想要调用，可以直接用utile包的getFromNamespace去调用 clusterProfiler包的bitr函数utils::getFromNamespace...

2019-11-08 13:56:33 1420

原创 MYSQL 报错 Got a packet bigger than 'max_allowed_packet' bytes

查看max_allowed_packet最大允许包输入命令 show VARIABLES like ‘%max_allowed_packet%’;回车即可查看max_allowed_packet最大允许包，解释一下包大小这个东西：简单来说就是mysql把当前执行的mysql语句看作是一个包，而对这个包大小的限制是对当前mysql语句长度的限制。显示如下±---------------...

2019-11-06 16:29:38 167

原创 R install.packages() 设置国内CRAN镜像

为避免 time out 这种情况，可以设置CRAN使用清华大学镜像，命令如下：options(repos=structure(c(CRAN=“https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/”)))

2019-11-06 14:06:28 1690

原创 Foldchange

foldChange<-function(inData,classLabel){#Calculating all probes’ FC valuesampleIdsCase<-which(classLabel0);#0 tumersampleIdsControl<-which(classLabel1);#1 normalprobeFC<-rep(0,nrow(in...

2019-10-25 16:51:56 808

原创 Unable to find an inherited method for function

library(dplyr)library(conflicted)##############################有些方法，譬如select ,会报错：Unable to find an inherited method for function ‘select’ for signature ‘“data.frame”’这是因为不同的包之间关于select方法有冲突libr...

2019-08-20 13:36:44 11405 1

原创 java11以上会出现安装后没有jre的情况

原因是：JDK11没有直接的jre，要用户选择jre模块：打开命令提示符，要cd到%JAVA_HOME%（D:\JAVA\JDK11）(用户安装路径)然后运行命令：bin\jlink.exe --module-path jmods --add-modules java.desktop --output jre会在本目录下生成jre文件夹win10是直接把jre和jdk的bin文件夹的路...

2019-06-02 19:44:00 6301 2

原创 java对数组操作

**根据元素index提取子数组**String [] results =new String[]{“1”,“2”,“3”,“1”,“2”,"3"“1”,“2”,“3”};results = Arrays.copyOfRange(results, 0, 5);0,5 启始和终止**数组转成字符串String.join("\t",arr);**...

2019-05-24 20:17:44 113

原创 page request without authorization

webstorm会出现的问题，按照下图的路径设置，勾选右下角的 Allow unsigned requests 即可解决

2019-05-04 16:53:19 329

原创关于selectpickers的reset失效问题

$('form').on('reset', function() { setTimeout(function() { $('.selectpicker').selectpicker('refresh'); });});懒的朋友可以直接用上面的代码，感兴趣的一步大型同性交友平台看看author们的讨论，链接如下https://github.com/snapap...

2019-04-26 12:10:06 741

原创代码块整理

eclispse和Webstorm都适用，代码块整体向左或者向右移动1.向右：将要移动的代码选中，然后按TAB键2.向左：将要移动的代码选中，然后按SHIFT+TAB键

2019-04-24 17:06:16 142

原创 echarts 折线图的位置大小设置通过grid{}

看图说话例子： grid: { x: 10, x2: 10, ...

2019-04-22 15:41:45 9051

原创安装R包时候 ERROR: 'configure' exists but is not executable

ERROR: 'configure' exists but is not executable -- see the 'R Installation and Administration Manual'Warning in install.packages : installation of package ‘e1071’ had non-zero exit statusIf you ...

2019-04-19 09:56:38 851

原创 MYSQL 乱码问题

2019-03-30 22:03:43 753

转载解决 wampserver 中无法启动mysql数据库的问题

问题描述：启动wampserver后，软件的图标用红色变为橙色之后，就一直保持原样了。只有当图标变成绿色的时候才能正常使用的。这里写图片描述图标中显示 local server -1 of 2 services running 。表示2个服务中只有一个服务启动。我们进去mysql里面看一下：这里写图片描述发现里面根本没有启动，点击启动之后，依旧不启动。打开phpMyAdmin页面，发...

2019-03-11 10:35:37 2112

原创 fatjar包在线安装为何会失败？慎点！

因为升级到最新版本的Eclipse后或是版本太高等等原因，在线安装Fatjar却无法使用了或是安装failed，刚好看到有一篇文章可以解决这个问题，所以借花献佛，希望对大家有帮助。 1.安装Eclipse2.0版本的插件支持方法如下： Help -> Install New Software… -> Work with 把下面地址粘贴到框中 http://download.eclips

2018-01-03 14:20:52 1524

原创 Java窗口关闭设置DISPOSE_ON_CLOSE和EXIT_ON_CLOSE 的区别

setDefaultCloseOperation()；是用来设定窗口被关闭时（比如点击了右上角的”x”）的行为。参数有： DISPOSE_ON_CLOSE：隐藏当前窗口，并释放窗体占有的其他资源。在窗口被关闭的时候会dispose这个窗口。 EXIT_ON_CLOSE：结束窗口所在的应用程序。在窗口被关闭的时候会退出JVM。如果程序没有其他线程在运行，当所有窗口都被dispose后，JV

2017-12-18 00:32:40 12180 1

原创 java JTextField之监听器

1.想要获取JTextField的改变删除更新信息。 public class Textmonitor extends JFrame implements DocumentListener{ @Override public void insertUpdate(DocumentEvent e) { System.out.println(“insert text”

2017-12-13 14:32:22 5066

原创 eclipse导出jar包，cmd指定main类运行

主要是为了开发GUI窗口,或者是 1、java项目没有导入第三方jar包的情况这时候打包就比较简单： ①首先在MyEclipse中打开项目，右键点击项目，选择“Export”； ②选择Java/JAR file，Next； ③Select the resources to export中可以选择你想要包含的项目文件夹，一些不必要的文件夹就无需放进去了，免得增大空间；这里有

2017-12-10 14:18:01 4304

转载 teamviewer 在 ubuntu 上的实现

1.打开终端，执行命令 sudo dpkg -i teamviewer_11.0.xxxxx_i386.deb 不加sudo 会提示照片中的错误：dpkg:error:requestd operation requires superuser privilege。继续跑，出现了Errors were encountered while processing:teamviewer:i386 这是由于

2017-11-20 10:44:53 2949

原创关于theano_GPU加速的配置

1.操作系统：Windows 7 （64位）Professional旗舰版。 2.Python环境及相关依赖包：Anaconda-1.9.2-Windows-x86_64。 3.Theano包安装：直接利用pipinstall theano命令即可完成安装。 4.检查电脑显卡是否支持GPU加速。如果显卡不支持GPU加速，到此就没有必要进行下面两

2017-09-28 15:54:41 1168

转载 optparse参数输入

from optparse import OptionParser [...] parser = OptionParser() parser.add_option("-f", "--file", dest="filename", help="write report to FILE", metavar="FILE") parser.

2017-09-26 13:14:22 474

原创盒子模型

块标签都具备盒子标签的特征内填充（padding），和边框的距离右四个方向 div{ padding-top:20px; padding-right:10px; padding-bottom:15px; padding-left:30px; }外边距（margin）距离也有四个方向外边框（border）距离也有四个方向 div{border-bottom:1p

2017-06-30 19:01:24 193

原创前端设计--HTML，CSS

HTML是网页内容的载体。内容就是网页制作者放在页面上想要让用户浏览的信息，可以包含文字、图片、视频等。CSS样式是表现。就像网页的外衣。比如，标题字体、颜色变化，或为标题加入背景图片、边框等。所有这些用来改变内容外观的东西称之为表现。JavaScript是用来实现网页上的特效效果。如：鼠标滑过弹出下拉菜单。或鼠标滑过表格的背景颜色改变。还有焦点新闻（新闻图片）的轮换。可以这么理解，有动画的，有

2017-06-29 17:21:25 335

原创 mysql连接HTML的一些问题

Mysql 使用的时候，以root创建普通用户的，设置时候有localhost，以及%选择，以及作死忘记密码，直接在bin目录下面，输入mysqld -nt –skip-grant-tables;（这一步骤必须要保证后台进程中mysql原先的已经关闭），然后关闭DOS界面，重新打开后直接输入mysql就可以进入，update user set password=password(“123”) whe

2017-06-23 19:19:53 1184

转载 materials about "miR-501 Alters Susceptibility to HCC"

1.哈迪－－温伯格平衡定律(Hardy–Weinberg equilibrium)：在一个有性生殖的种群中,种群足够大,种群内个体随机交配,没有突变,没有新基因的加入,没有自然先择,种群中各等位基因的频率代代保持稳定不变. 即：一是等位基因频率逐代不变，因此在这个座位基因库不会进化。二基因型频率将以p^2,2pq和q^2的比例存在于随机交配的以后的各代中。群体的基因型频率以这个比率存在时就称为

2017-05-11 20:48:55 556

转载热图的绘制

R中的一个pheatmap包 library（pheatmap） pheatmap(mat, color = colorRampPalette(rev(brewer.pal(n = 7, name = “RdYlBu”)))(100), kmeans_k = NA, breaks = NA, border_color = “grey60”, cellwidth = NA, cellh

2017-05-06 14:52:08 1548

空空如也

空空如也