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RSS订阅原创 内存：VSS/RSS/PSS/USS区别和监控
软件开发的最后阶段就是测试，了解软件整体的cpu和mem使用情况，之前一直用ps来确定cpu使用率和rss内存，最近监控python多进程软件时，累积rss竟然超过了节点物理内存126G，原因在此处梳理下。先说结论：一般情况下有：VSS >= RSS >= PSS >= USS。VSS - Virtual Set Size 虚拟耗用内存(包含共享库占用的内存)RSS - R...
2021-10-26 15:34:32
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原创 set -e导致脚本退出的情况
本来不加set什么事儿都没有(已测试结果无误)，加上set -e后就出来问题了：read_len计算结果为94set -e正常情况下set -eread_len=`zcat demo.fq.gz | head -n 2 | tail -1 | wc -L`# || echo "read len"echo "---"echo $read_lentri_len=`expr $r...
2020-12-08 14:39:31
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原创 使用readthedocs+github+sphinx+reST构建文档
安装pip install --user sphinx sphinx-autobuild sphinx_rtd_themeread the docssphinx使用手册参考：如何用 ReadtheDocs、Sphinx 快速搭建写书环境
2020-09-24 10:55:04
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原创 CPU、并行、
CPU型号查看个数lscpu确认，该机子如下：4颗物理CPU #sockets每颗是10核 #cores per socket每个核支持2线程 #threads per core总共80个物理CPU，也就是80个线程（4102）参考：linux下怎么查看cpu核数...
2020-08-26 16:12:42
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原创 网络爬虫：魔道祖师小说
好奇总被人提及的网络爬虫到底是什么技术，于是也想用，我的需求是可以下载小说、文献摘要、还有各种生信数据库的网站抓取等，先拿我喜欢的魔道祖师小说来练手。如果懂点HTML/CSS/JS的话，基于网页的标签去读取识别，很简单了，直接上代码：class downloader(object): def __init__(self): self.server = 'http://...
2020-08-06 14:30:44
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空空如也
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