- 博客(5)
- 资源 (57)
- 收藏
- 关注
RSS订阅转载 使用 GCE 进行基因组大小评估
使用 GCE 进行基因组大小评估1. GCE 简介GCE(Genome Characteristics Estimation) 是华大基因用于基因组评估的软件，其参考文献为：Estimation of genomic characteristics by analyzing k-mer frequency in de novo genome projects。下载地址：ftp://ftp.genomics.org.cn/pub/gce。GCE 软件包中主要包含 kmer_freq_hash 和
2022-03-31 14:55:46
2155
转载 jellyfish的安装和使用
JELLYFISH是CBCB(Center for Bioinformatics and Computational Biology)的Guillaume Marçais 和 Carl Kingsford 研发的一款计数 DNA 的 k-mers 的软件。该软件运用 Hash 表来存储数据，同时能多线程运行，速度快，内存消耗小。该软件只能运行在64位的Linux系统下。其文章于2011年发表在杂志 Bioinformatics 上。JELLYFISH安装$ wget http://www.cbc.
2022-03-30 15:46:50
5771
2
转载 Identity, Positive, 和Similarity的区别
identity和similarity有什么区别，发现自己对这几个概念也不甚了了，于是做了点功课，如下。第一反应 去查了BLAST的glossaryIdentityThe extent to which two (nucleotide or amino acid) sequences are invariant.SimilarityThe extent to which nucleotide or protein sequences are related. The extentof s.
2021-11-24 11:18:34
2404
转载 其他blast使用方法
程序名 搜索序列 数据库 内容 备注blastp Protein Protein 比较氨基酸序列与蛋白质数据库 使用取代矩阵寻找较远的关系，进行SEG过滤blastn Nucleotide Nucleotide 比较核酸序列与核酸数据库 寻找较高分值的匹配，对较远的关系不太适用blastx Nucleotide ...
2021-11-24 11:05:33
873
【全美经典】46[1]. 关系数据库习题与解答（中文版)
2007-07-05
比较基因组学Comparative Genomics Using Fungi as Models
2009-10-11
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人