Molecular_Model-CSDN博客

原创用AutoDock进行分子对接教程——半柔性对接

四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn)，专业从事分子模拟，量子化学等计算服务，欢迎咨询！Autodock分子对接教程Autodock是一款分子对接软件包，开源且免费，官方网址是http://autodock.scripps.edu/，目前最新的版本是AutoDock4.2.6，包括AutoDock和AutoGrid两个模块，AutoDock软件包下载地址为http:...

2017-12-20 21:14:42 44417 7

原创如何做出漂亮的序列比对图——ENDscript/ESPript

以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn)，专业从事分子模拟，量子化学等计算服务，欢迎咨询！大家经常在文献中看到非常好看的序列比对图，现在笔者将目前见过的最好看的序列比对图的作图方法作分享，希望对大家的科研工作有所帮助，效果图如下：1、在蛋白质数据、Genbank、Uniprot等数据库搜索得到蛋白质...

2017-12-16 21:35:49 60406

原创短链脱氢酶催化合成奥利司他中间体的机制研究

四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn)，专业从事分子模拟，量子化学等计算服务，欢迎咨询！

2021-06-09 14:28:23 478

原创分子间相互作用——偶极作用dipolar-dopolar interaction

分子间相互作用——偶极作用dipolar-dopolar interactionFirst release：2019-07-09 Last update: 2019-07-09 四川魔德科技有限公司(www.mod...

2019-07-09 11:18:37 8578

原创 Linux中快速创建大量文件夹的命令

Linux下快速创建大量文件夹的命令 First release：2018-08-07 Last update: 2018-08-14四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn)，专业...

2019-07-08 17:12:11 5727

原创 AMBER中mdout_analyzer.py和ambpdb的使用

AMBER中mdout_analyzer.py和ambpdb的使用 First release：2018-07-22 Last update: 2018-07-22 四川魔...

2019-07-08 17:08:48 1501

原创 Amber和Gaussian联用计算RESP原子电荷

Amber和Gaussian联用计算RESP原子电荷 First release：2018-03-17 Last update: 2018-07-22 ...

2019-07-08 17:06:13 3389

原创批量下载Zinc数据库中小分子的方法

批量下载Zinc数据库中小分子的方法First release：2017-01-31 Last update: 2018-01-31四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn)，专业从事分子模拟，量子化学等计算服务，欢迎咨询！Zinc数据库不用多说，大多数化学研究的工作者都“如雷贯耳”，但是真正使用过的人却很少，本文为大家介绍下载Zinc数据库中的小分子的方法，为做药物筛选...

2018-10-28 09:41:51 15262

原创 AutoDock进行柔性分子对接教程

Autodock 柔性分子对接教程First release：2018-9-22 Last update: 2018-9-22四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn)，专业从事分子模拟，量子化学等计算服务，欢迎咨询！Autodock是一款分子对接软件包，开源且免费，官方网址是http://autodock.scripps.edu/，目前最新的版本是AutoDock 4....

2018-10-28 09:39:49 12156

原创用Amber进行能量分解和计算结合自由能——MMPBSA工具

用Amber进行能量分解和计算结合自由能First release：2018-01-13 Last update: 2018-03-17四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn)，专业从事分子模拟，量子化学等计算服务，欢迎咨询！Amber是一款适用于生物大分子的动力学模拟的软件，其官方网站是http://ambermd.org/index.html，目前最新版本为A...

2018-10-28 09:36:13 9774

原创计算表面静电势_APBS工具

以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn)，专业从事分子模拟，量子化学等计算服务，欢迎咨询！ APBS工具是一种可以绘制表面静电势的工具，目前在多个软件中均有APBS的插件，如VMD、PyMOL等，但是笔者都使用过这些工具，发现Chimera软件的APBS工具是最方便的，效果图如下所示，适合于初学者，下面我...

2017-12-14 20:50:51 9197 2

原创采用Modeller进行同源建模_单模板建模

以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn)，专业从事分子模拟，量子化学等计算服务，欢迎咨询！ Modeller是一款比较优秀的同源建模软件，包括单模板和多模板建模，Discovery Studio软件中就是采用的Modeller建模模块。Modeller目前最新的版本是9.19，下载网址为http...

2017-12-12 21:55:12 13463 1

duwenyi2017的博客