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RSS订阅原创 SVM参数优化
SVM参数优化导入包from sklearn.svm import SVCfrom sklearn.model_selection import GridSearchCV将SVM的C值和gamma调参，C值范围为2−5{2^{-5}}2−5到215{2^{15}}215， gamma值范围为2−15{2^{-15}}2−15到23{2^{3}}23.lmh_svm = SVC(deci...
2019-09-23 09:09:32
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原创 下载 sra-toolkit
下载ncbi的数据从ncbi下载 sra-toolkit（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/docs/toolkitsoft/）选择你的系统版本下载并解压下载sra序列SRR_Acc_List.txt是SRR号的文件prefetch --option-file SRR_Acc_List.txt -O /media/sdc/data或者使用aspera下...
2019-09-22 19:09:38
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原创 limma包进行差异分析
limma包进行差异分析载入limma包，利用edgeR的标准化方法library(edgeR)library(limma)读取两组对比的数据a<-read.table("E3和E4.txt")E3有81个样本，E4有190个样本，所以创建一个dataframe来统计样本的信息condition<-data.frame(lane=(1:271),treatment=r...
2019-09-22 17:23:44
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原创 仙人掌的图片识别
仙人掌的图片识别数据来自kaggle的Aerial Cactus Identification项目（https://www.kaggle.com/c/aerial-cactus-identification）下载数据# 终端运行kaggle competitions download -c aerial-cactus-identificationunzip train.zipunzip...
2019-09-22 13:11:48
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原创 标准化数据常用的3种方法
标准化数据的方法z-score方法from sklearn import preprocessingX_train = np.array([[ 1., -1., 2.], [ 2., 0., 0.], [ 0., 1., -1.]])X_scaled = preprocessing.scale(X_tr...
2019-09-22 11:20:10
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空空如也
空空如也
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