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原创 SimpleITK读取并显示单张dcm文件

import SimpleITK as sitkimport numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltimage = sitk.ReadImage(r"D:\Data\LIDC-IDRI\DOI\LIDC-IDRI-0162\1.3.6.1.4.1.14519.5.2.1.6279.6001.100063870746088919758706456...

2018-08-07 09:40:44 5554 6

原创 python 读取并显示 .nii格式文件(nibabel库)

pip install nibabelimport nibabel as nibimport skimage.io as ioimport numpy as npimg=nib.load('1.nii')img_arr=img.get_fdata()img_arr=np.squeeze(img_arr)io.imshow(img_arr)

2018-06-28 12:27:07 27801 9

原创 YOLO v1 confidence解释

训练集的label中,confidence的值不是1,而是当前的P(object)(0|1)与当前的IOU的乘积,目标是使训练出的模型输出的confidence无限接近真实的P(object)*iou我最开始理解的是,训练集的label中有物体的格子,confidence的label为1,训练过程中预测的confidence为当前的iou,可是这样的话,其实训练confidence的结果就相当于边...

2018-05-27 09:53:12 2659 4

原创 proposal_target_layer与archor_target_layer

1.archor_target_layer产生RPN训练阶段所用的label,总共256个(TRAIN.RPN_BATCHSIZE ),每个label包括两部分,第一部分是所属的类别(前景/背景),第二部分是坐标偏移量(dx,dy,dw,dh),这256个sample将用来训练RPN2.RPN训练完后,将用其生成的类别信息和坐标偏移信息,并结合proposal_layer,py,生成proposa...

2018-05-23 09:31:01 566 1

原创 NiftyNet开源平台使用

NiftyNet是一款开源的卷积神经网络平台,专门针对医学图像处理分析,下面简单介绍一下我目前了解到的使用方法,进一步学习请查看官方文档NiftyNet有很强的易用性,数据层,应用层,网络层等是完全独立的, 数据层(NiftyNet/niftynet/io),负责医学图像的读取,目前读取器有以下几种:1. nibabel 支持.nii医学文件格式2. simpleitk 支持.dcm和 .mhd格...

2018-05-19 22:50:15 3026

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