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RSS订阅原创 【最新版protocol】16S qiime2 ASV分析
#一、导入数据Import data分析前需要准备的文件见上一篇文章qiime tools import \ --type 'SampleData[PairedEndSequencesWithQuality]' \ --input-path sample_data/pe-33-manifest.csv \ --output-path results/paired-end-demux.qza \ --input-format PairedEndFastqManifestPhred33#
2021-08-18 12:37:29
3753
原创 16S多样性ASV分析-低氧区ODZ水层分析
第一节. 质控,实验设计,双端序列合并（在Qiime1中进行）此部分内容来自https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/769039981.看测序质量共分为以下几步：①安装fastqc先把原始数据做fastqc, 结果放进multiQC，看原始数据质量如何，有没有adapter#首先安装好fastqc# 下载fastqc http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/downloa
2020-10-05 20:25:20
10845
空空如也
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