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原创 R如何输出001,002,003等序号/编号?
需求R默认带文本的编号不是按数字来排序的,这会对数据排序造成一定影响。如paste0("sample",1:10)在列中排序不是按1-100,而是按ASCII排序。> sort(paste0("sample",1:10)) [1] "sample1" "sample10" "sample2" "sample3" "sample4" "sample5"  
2022-10-17 21:16:26 1135
原创 使用transanno制作不同基因组版本坐标映射的chain 文件?
不同基因组版本的位置(坐标)对应关系,在数据分析环节经常用到。位置对应关系通常通过比对来获取,而信息一般存储在chain文件中。对于人类、小鼠等模式生物而言,UCSC已经提供了不同版本的chain文件。对于非模式生物,往往需要先自己制作chian文件,再通过ncbi的remap,UCSC的lifeover和crossmap等工具进行坐标转换。UCSC官网也提供了制作chain文件的方法。但需要parasol集群环境(需要root)。这一步的设置往往难倒了不少人,尤其是ssh localhost。最
2022-09-17 20:42:41 1314 1
illumina广告genomic-selection-in-agriculture.pdf
2021-01-20
R语言数据科学
2018-10-24
空空如也
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