Jun-H-CSDN博客

原创静态与动态链接库

为了方便编写程序与提高程序的可重复性，我们可以将一些公用的函数或功能模块打包成库，使得下次编写程序时使用方便（无需重新编写，只需将库连接到程序中即可使用）。连接方式分为以下两种：1. 静态链接所谓静态链接是指把需要调用的包含在库中的函数或者功能模块链接到可执行文件（如Windows系统的exe文件、Linux系统中无扩展名的可执行文件）中，成为可执行文件的一部分。换句话说，函数和过

2016-11-03 12:39:15 491

原创 HHsuite使用初探

1. hhfilter: 过滤MSA信息的，可将序列相似度（-id 90）、gap过多(-cov 80)从MSA中移除。2. hmmsearch 将hmm文件（隐马尔可夫模型）搜索FASTA文件3. hmmbuild 可将MSA生存hmm文件（隐马尔可夫模型）...

2020-06-11 09:02:05 1803

Q: Linux 32位系统下可以执行的程序，64位系统不能执行A: > dpkg –add-architecture i386 > apt install libc6:i386Q: Linux普通用户如何安装自己的应用程序A:获取源代码；常用wget/curl下载，也可以用类似apt-get source的方式获取仓库中软件源代码；解压源代码安装包；例如对于gzip格式的tar包：tar -zxvf xxx.tar.gz；切换到解压后的目录，运行 ./co...

2020-06-02 23:23:51 266

原创人与优秀

几个问题一直困扰着我：1）人需不需要优秀2）人为什么要优秀3）人怎样去优秀4）为了优秀，人应该付出什么5）不优秀了，又能怎样...

2019-12-19 21:51:36 324

转载 Linux crontab命令详解

Linux crontab命令详解crontab：定时任务的守护进程，精确到分，设计秒的我们一般写脚本 -->相当于闹钟日志文件: ll /var/log/cron* 编辑文件： vim /etc/crontab 进程：ps -ef | grep crond ==> /etc/init.d/crond resta...

2019-12-01 21:36:28 368

原创 Matlab画带星的ROC曲线

function [AUC betterthreshold MCCMAXThreshold Confuse_Matrix MCCs FPRs TPRs F1S] = ROC_2_Class_OneFile_WithStar(begin_threshold, end_threshold, step, ismaxmcc,classificationFileName, star_num, star_s...

2019-10-27 07:22:44 599

转载 [转载]MATLAB 可以画的各种类型的图总结

MATLAB 可以画的各种类型的图总结MATLAB®提供了各种可用来绘制数据图的函数。下表对常见的图形函数进行了分类和说明。线图数据分布图离散数据图极坐标图等高线图向量场 plot area stairs polarplot contour ...

2019-09-20 16:59:19 2909

转载 Ubuntu 64 ./xxx 跳出来说没有这个文件或者目录

Ubuntu 64位下运行 ./xxx 会跳出来说没有这个文件或者目录，但是ls看又有这个文件，很是奇怪。其实原因很简单，是因为他没有32位的运行库 ia32-libs，直接安装即可。apt-get install ia32-libs我使用的Ubuntu版本是16.04，安装后提示没有可用的软件包ia32-libs，但是它被其它的软件包引用了。这可能...

2019-04-14 16:22:48 1126

转载 Linux环境下非root用户安装Python及相关库

非root权限安装Python及其安装包

2017-05-03 09:27:12 1370

原创差分进化算法(Differential Evolution) JAVA代码样例

差分进化算法（Differential Evolution）是一个经典的智能优化算法。虽然其很难得到最优解，但是差分进化算法可以在有限的资源与时间能寻得次优解。将差分进化算法应用到参数寻优上往往可以获得意想不到的结果。

2017-03-24 08:20:05 4685

原创蛋白质PDB文件读取C++代码

在生物信息学中，PDB数据库是非常重要的蛋白质结构数据库。PDB数据文件的读取是进行蛋白质结构相关预测的重要步骤！下面给出了简单的PDB文件读取的C++代码，以供参考.

2017-03-24 06:29:48 3152 2

转载 If your Linux has some problem, this file could help you.

Linux problem

2017-02-08 12:04:05 581

原创 Java代码可自动从网络上下载文件

你可以使用java代码自动的从网络上批量下载文件！

2017-01-05 09:38:54 2652

原创如何在Linux系统中查找JDK安装路径

1. 如果你已经配置了JDK的环境变量> echo $JAVA_HOME2. 如果你没有配置JDK的环境变量>which java/usr/bin/java>ls -lrt /usr/bin/javalrwxrwxrwx. 1 root root 26 Mar 26 2015 /usr/bin/java -> /usr/java/default/bin/java

2016-12-15 04:25:50 1060

原创 Shell脚本调用java程序 Example

在没有设置java全局环境变量时，Shell脚本调用java程序需要配置环境变量。

2016-12-14 01:16:19 1475

转载 Linux scp rsync 远程copy

rsync它比scp更强大，支持“不覆盖”原目录例子：rsync -avz --progress /root/client/ [email protected]:/home/work/ //将本机的/root/client/拷贝至远程的202.112.23.12:/home/work/目录，--progress可以查看拷贝的过程

2016-11-09 11:54:46 425

转载 CentOS配置固定IP与DNS域名

修改对应网卡的DNS的配置文件sudo vi /etc/resolv.conf 修改以下内容nameserver 8.8.8.8 #google域名服务器nameserver 8.8.4.4 #google域名服务器2、CentOS 修改网关修改对应网卡的网关的配置文件[root@centos]# vi /etc/sysconfig/network修改

2016-11-03 11:52:24 709

原创 PDB文件头中时间格式解析

在做生物信息学时，经常需要使用到Protein Data Bank中的数据，时不时的需要使用PDB文件中的时间（时间格式为10-MAR-14 (2014年三月10日)）将已有数据分成训练数据和独立测试数据，时间如何解析是一件比较简单的事情，为了方便寻找故将这段代码贴在这里。private static double parsePDBTimeStr(String pdb_time){ //

2016-09-09 23:01:27 897

原创 Latex表格设计（未完待续）

% \begin{table}% \centering% \caption{Composition of Training Dataset and Independent Validation Dataset for the Three Databases}\label{datainfo}% \begin{tabular}{|c|c|c|c|c|c|c|}% \

2014-12-11 19:20:31 1092

转载 CentOS JDK install

第一步：查看Linux自带的JDK是否已安装（卸载centOS已安装的1.4）安装好的CentOS会自带OpenJdk,用命令 java -version ，会有下面的信息：java version "1.6.0"OpenJDK Runtime Environment (build 1.6.0-b09)OpenJDK 64-Bit Server VM (build 1.6.0-b

2014-11-17 21:19:39 679

转载 Sublime Text 2快捷操作

Sublime Text 2包含了大量快捷操作，而且还很方便修改和追加自己喜欢的快捷键。查看快捷键的方式也很简单：点击菜单栏：Preferences->Key Bindings –Defaults 即可查看。快捷键：打开/前往Ctrl+P：搜索项目中的文件Ctrl+G：跳转到第几行Ctrl+R：前往 methodctrl+; ：前往字段Ctrl+Shift+

2014-11-12 09:47:41 781

转载 Matlab并行（持续更新）

Mathwoks在Matlab R2007a版本的Parallel Computing Toolbox（并行计算工具箱）中加入了并行循环parfor-loops，对于每一步可以独立于其他步的循环，计算效率可以有较大幅度的提高。以前简单的for循环for-loop是顺序的(sequentially)执行每一步循环体(statement)，parfor-loop是通过将各个循环体分配到不同的节点上进行

2014-11-05 10:21:03 1586

转载流形学习

流形（manifold）的概念最早是在1854年由 Riemann 提出的(德文Mannigfaltigkeit)，现代使用的流形定义则是由 Hermann Weyl 在1913年给出的。江泽涵先生对这个名词的翻译出自文天祥《正气歌》“天地有正气，杂然赋流形”，日本人则将之译为“多样体”，二者孰雅孰鄙，高下立判。流形（Manifold），一般可以认为是局部具有欧氏空间性质的空间。而实际

2014-10-31 12:03:03 3531 1

转载 ROC曲线及AUC评价指标

很多时候，我们希望对一个二值分类器的性能进行评价，AUC正是这样一种用来度量分类模型好坏的一个标准。现实中样本在不同类别上的不均衡分布(class distribution imbalance problem)，使得accuracy这样的传统的度量标准不能恰当的反应分类器的性能。举个例子：测试样本中有A类样本90个，B 类样本10个。若某个分类器简单的将所有样本都划分成A类，那么在这个测试样本

2014-10-22 11:35:51 1572

转载生物信息学：神秘的新职业

生物信息学：神秘的新职业来源：科学新闻作者： Alaina G. Levine /文姜天海/译 2014年10月09日关键词：生物信息学,大数据,个性化,计算机科学摘要：今天的生物信息学家迎来了好时候。由于各个部门生成了几乎无穷无尽的生物数据，因此形成了对于生物、统计学和计算机科学交叉领域中有经验的专业人才的高度需求。科学家如果能够分析大量信

2014-10-10 22:11:57 2034

原创只拷贝文件不拷贝文件夹的Java程序

只拷贝文件不拷贝文件夹的Java程序

2014-09-26 22:12:34 1051

转载大数据时代的生物医学

【题】大数据时代的生物医学【出处】《中国计算机学会通讯》第 9 卷第 9 期 2013 年 9 月刊【作者】刘　雷关键词：大数据　生物医学大数据时代的生物医药科学研究活动特点如今大数据时代已经悄然而至。生命科学领域里以脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid, DNA) 双螺旋结构的提出为起点，在20 世纪后期出现了飞跃式的发展。几个具有重

2014-09-22 19:32:30 5651

原创英雄会上的一些题

第五届在线编程大赛月赛指定题目：反向互补子串，自己的一些想法（见代码），欢迎广大码农来交流！

2014-09-22 18:46:52 1200 7

转载待解决的英雄会上的一些题

AB串返回首页发布公司：有效期：CSDN2014-05-29至2015-05-29难度等级：答题时长：编程语言要求：120分钟C C++ Java C#题目详情给定n个A和2n个B，用这些字符拼成一个字符串，要求这个串的所有前缀和后缀B的个数始终不少于A。（一个字符串

2014-09-21 20:56:44 793

原创英雄会上的一些题

题2：平安科技在线编程大赛：一份“奇妙”的银行流水

2014-09-21 20:32:21 721

原创英雄会上的一些题

平安科技在线编程大赛：一份“奇妙”的银行流水

2014-09-21 20:28:35 1045

转载发表在 Science 上的一种新聚类算法

今年 6 月份，Alex Rodriguez 和 Alessandro Laio 在 Science 上发表了一篇名为《Clustering by fast search and find of density peaks》的文章，为聚类算法的设计提供了一种新的思路。虽然文章出来后遭到了众多读者的质疑，但整体而言，新聚类算法的基本思想很新颖，且简单明快，值得学习。这个新聚类算法的核心思想在于对聚类

2014-09-19 23:23:56 27311 10

转载 Sublime Text 2搭建Java开发环境

《Sublime Text 2搭建Java开发环境》只是源于作者：chszs，转载需注明。源于作者博客主页：http://blog.csdn.net/chszsSublime Text 2是我非常喜欢的文本编辑器，它美观漂亮、轻量级。本文讲述怎样在Sublime Text 2上搭建Java开发环境，使得可以在Sublime上编译和运行Java程序。1. 设置Ja

2014-09-04 15:59:34 2309 1

转载 Sublime text2 C/C++ 编译环境设置

sublime 是一款强大的跨平台代码编辑器，小巧而且丰富实用的功能是Visual Studio不能比拟的，但是编译运行是一个软肋，本文通过在sublime中配置g++编译器实现程序的编译功能。具体做法一共有四个步骤：下载安装Sublime text2 for windows下载安装 MinGW 与系统变量设置Sublime Building System 设置编译测

2014-09-03 15:45:57 1083

转载 CentOS远程桌面

必须明白：vncserver在调用的时候，会根据你的配置来启用server端的监听端口，端口默认是从5900开始，再加上你的桌面号。比如你的桌面号为1，则vnc的连接端口号为5900+1=5901比如你的桌面号为10000，则vnc的连接端口号为5900+10000=15900===================================================

2014-08-22 11:26:11 948

原创 FuzzyKNN matlab code

function predict_labels = fuzzyKNN(train_samples, k, fa, test_features)% train_samples : samples_num * (feature_num + 1) feature_numPlus1 = size(train_samples, 2); train_features = train_samp

2014-06-28 17:56:39 1809 1

原创 TeamViewer一个很好的免费远程控制软件

近期在网上发现了一款很好使用的远程访问Teamiewer

2014-06-17 15:45:06 1953

转载 CentOS 6.5安装nvidia显卡驱动

from : http://jingyan.baidu.com/article/9f63fb91d7e6b5c8400f0e0c.html

2014-06-16 08:33:55 2003

转载 centos6 can't mount ntfs

centos6 can't mount ntfs[Quoted]Re: Unable to mount ntfs partition on CentOS 6. #3 Newbie Joined:2011/7/22 From Posts:2 i had the same problem and i solved through RPMForge... with

2014-06-15 12:54:40 910 1

转载 CentOS 6.5汉语输入法安装

linux CentOS中文输入法安装及设置centos 6.3用yum安装中文输入法1.需要root权限，所以要用root登录，或su root2.yuminstall "@Chinese Support"3.exit4.回到桌面，system->preferences->input method5.如果没有，先注销一下。6.按照提示添加输入法。

2014-06-13 23:57:59 1952