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原创 Design sequences using genetic algorithm
The importance of DNA sequence design for reliable DNA computing is well recognized. Deaton and Grazon, for example, identified various types of errors those lead to false positives in Adleams origi
2006-06-09 14:04:00 994
原创 单模板方法(single template strategy)
Arita提出了单模板方法,实际上是把DNA计算中的编码问题归结为两个子问题:求的一个好的模板和一个纠错码集合。模板的性能决定了DNA序列的性能,因此在单模板方法中,如何求模板是关键的问题。他提出了一个mass的概念,即模板的性能。定义mass的值为||x||=min(h(x,x),h(x,xr),HM(x,rxr>),HM(x,))。实际上mass的值为模板和自身连接以及自身的反连接之间的移
2006-06-02 18:51:00 1033
原创 模板编码方法(template method)
模板编码方法是一种DNA序列编码的新方法,它将四字母的编码问题转化为01编码的问题。即DNA碱基的AGCT有二进制的01根据不同的组合生成。 模板方法最初有wisconsin大学的frutos等人提出。主要思想是:通过一个二进制的序列的模板集合(template)和另一个二进制序列的映射集合(map)生成满足要求的DNA序列集合。其生成的规则是:1×1-T 、1×0-A、0×1-G、0×0-
2006-05-19 19:17:00 1207
原创 DNA 计算-新的计算模式
自从adleman博士在Science上发表了一篇Molecular Computation of Solution to Combinatorial problems论文后,揭开了一个新的领域-利用生物大分子来实现计算的。这也让人们看到了实现生物计算的希望。 adleman博士利用DNA计算实现了7节点的hamilton路问题。具体的实验分为5个步骤:1、产生经历有向图节点的随机路径。
2006-05-03 21:37:00 1631 1
空空如也
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